Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3RF3Q8TEJ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3RF3Q8TEJ3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3RF3Q8TEJ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3RF3Q8TEJ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3RF3Q8TEJ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3RF3Q8TEJ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3RF3Q8TEJ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3RF3Q8TEJ3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3RF3Q8TEJ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3RF3Q8TEJ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3RF3Q8TEJ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3RF3Q8TEJ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3RF3Q8TEJ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3RF3Q8TEJ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3RF3Q8TEJ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3RF3Q8TEJ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3RF3Q8TEJ3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3RF3Q8TEJ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms