Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MGARPQ8TDB4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGARPQ8TDB4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGARPQ8TDB4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms