Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC110Q8TBZ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC110Q8TBZ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms