Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BEST2Q8NFU1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEST2Q8NFU1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms