Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBOF1Q8ND07 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOF1Q8ND07 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOF1Q8ND07 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms