Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDPRQ8NCN5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDPRQ8NCN5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms