Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNBD1Q8NA66 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNBD1Q8NA66 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms