Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNLDC1Q8NA58 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.1 ms