Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANKRD42Q8N9B4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD42Q8N9B4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD42Q8N9B4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms