Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
AMER3Q8N944 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMER3Q8N944 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms