Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBR7Q8N806 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBR7Q8N806 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms