Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDCL2Q8N4E4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCL2Q8N4E4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms