Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
VPS8Q8N3P4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
VPS8Q8N3P4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
VPS8Q8N3P4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
VPS8Q8N3P4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
VPS8Q8N3P4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
VPS8Q8N3P4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
VPS8Q8N3P4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
VPS8Q8N3P4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
VPS8Q8N3P4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms