Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00518Q8N0U6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINC00518Q8N0U6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms