Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUR6

CREBRF, CREB3 regulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREBRFQ8IUR6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CREBRFQ8IUR6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CREBRFQ8IUR6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREBRFQ8IUR6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREBRFQ8IUR6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CREBRFQ8IUR6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREBRFQ8IUR6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CREBRFQ8IUR6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREBRFQ8IUR6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREBRFQ8IUR6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREBRFQ8IUR6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREBRFQ8IUR6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREBRFQ8IUR6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CREBRFQ8IUR6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREBRFQ8IUR6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms