Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PALB2Q86YC2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PALB2Q86YC2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALB2Q86YC2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms