Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS37DQ86XT2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS37DQ86XT2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS37DQ86XT2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS37DQ86XT2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS37DQ86XT2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS37DQ86XT2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS37DQ86XT2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
VPS37DQ86XT2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
VPS37DQ86XT2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS37DQ86XT2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS37DQ86XT2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms