Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO2Q7Z6W1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO2Q7Z6W1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO2Q7Z6W1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms