Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBBP6Q7Z6E9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP6Q7Z6E9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms