Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP9Q7RTR0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP9Q7RTR0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms