Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q7L0L9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q7L0L9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q7L0L9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q7L0L9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q7L0L9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q7L0L9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q7L0L9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q7L0L9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q7L0L9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q7L0L9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q7L0L9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q7L0L9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Q7L0L9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q7L0L9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q7L0L9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q7L0L9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q7L0L9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q7L0L9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Q7L0L9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q7L0L9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q7L0L9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q7L0L9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q7L0L9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q7L0L9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q7L0L9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q7L0L9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q7L0L9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Q7L0L9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q7L0L9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Q7L0L9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q7L0L9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Q7L0L9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q7L0L9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q7L0L9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q7L0L9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q7L0L9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q7L0L9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q7L0L9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q7L0L9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q7L0L9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q7L0L9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q7L0L9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q7L0L9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q7L0L9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q7L0L9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q7L0L9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q7L0L9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q7L0L9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q7L0L9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q7L0L9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Q7L0L9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q7L0L9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q7L0L9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q7L0L9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q7L0L9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q7L0L9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q7L0L9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q7L0L9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q7L0L9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q7L0L9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q7L0L9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q7L0L9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q7L0L9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q7L0L9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q7L0L9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q7L0L9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Q7L0L9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q7L0L9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Q7L0L9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q7L0L9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q7L0L9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q7L0L9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Q7L0L9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q7L0L9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q7L0L9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Q7L0L9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q7L0L9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q7L0L9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q7L0L9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q7L0L9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q7L0L9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q7L0L9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q7L0L9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q7L0L9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q7L0L9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q7L0L9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q7L0L9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q7L0L9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Q7L0L9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q7L0L9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q7L0L9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q7L0L9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q7L0L9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q7L0L9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q7L0L9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q7L0L9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q7L0L9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q7L0L9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q7L0L9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms