Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2AQ7L0J3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SV2AQ7L0J3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SV2AQ7L0J3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms