Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BBS12Q6ZW61 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BBS12Q6ZW61 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms