Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf139Q6ZV77 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf139Q6ZV77 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms