Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPGS1Q6ZTW0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPGS1Q6ZTW0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPGS1Q6ZTW0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms