Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
UBR3Q6ZT12 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBR3Q6ZT12 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBR3Q6ZT12 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms