Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY4Q6ZNE9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY4Q6ZNE9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms