Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC36A4Q6YBV0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A4Q6YBV0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC36A4Q6YBV0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC36A4Q6YBV0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC36A4Q6YBV0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC36A4Q6YBV0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC36A4Q6YBV0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC36A4Q6YBV0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC36A4Q6YBV0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC36A4Q6YBV0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC36A4Q6YBV0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC36A4Q6YBV0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC36A4Q6YBV0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC36A4Q6YBV0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms