Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HRCT1Q6UXD1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HRCT1Q6UXD1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms