Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLPSL2Q6UWE3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms