Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASC1Q6TDU7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASC1Q6TDU7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASC1Q6TDU7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASC1Q6TDU7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASC1Q6TDU7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASC1Q6TDU7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASC1Q6TDU7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASC1Q6TDU7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASC1Q6TDU7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASC1Q6TDU7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASC1Q6TDU7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASC1Q6TDU7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASC1Q6TDU7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASC1Q6TDU7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASC1Q6TDU7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASC1Q6TDU7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASC1Q6TDU7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CASC1Q6TDU7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms