Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SARM1Q6SZW1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SARM1Q6SZW1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SARM1Q6SZW1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms