Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A47Q6Q0C1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A47Q6Q0C1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms