Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL35Q6PF15 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL35Q6PF15 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms