Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD74

AAGAB, Alpha- and gamma-adaptin-binding protein p34, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAGABQ6PD74 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AAGABQ6PD74 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AAGABQ6PD74 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms