Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMBQ6PCB8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMBQ6PCB8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms