Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF544Q6NX49 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF544Q6NX49 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms