Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRNP1Q6NT89 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRNP1Q6NT89 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRNP1Q6NT89 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms