Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ABLIM2Q6H8Q1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ABLIM2Q6H8Q1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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