Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E4F1Q66K89 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E4F1Q66K89 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E4F1Q66K89 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms