Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SUSD4Q5VX71 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SUSD4Q5VX71 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SUSD4Q5VX71 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms