Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM46CQ5VWP2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM46CQ5VWP2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms