Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCERG1LQ5VWI1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TCERG1LQ5VWI1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCERG1LQ5VWI1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCERG1LQ5VWI1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCERG1LQ5VWI1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TCERG1LQ5VWI1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCERG1LQ5VWI1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCERG1LQ5VWI1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCERG1LQ5VWI1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCERG1LQ5VWI1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCERG1LQ5VWI1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCERG1LQ5VWI1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCERG1LQ5VWI1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCERG1LQ5VWI1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCERG1LQ5VWI1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms