Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO4Q5TGY1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCO4Q5TGY1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCO4Q5TGY1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms