Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRTP1Q5TC63 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GRTP1Q5TC63 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRTP1Q5TC63 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms