Protein–RNA interactions for Protein: Q5T481

RBM20, RNA-binding protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM20Q5T481 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM20Q5T481 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM20Q5T481 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms