Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC3LQ5T215 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC3LQ5T215 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms