Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAP1Q5SW96 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAP1Q5SW96 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.3 ms