Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM240Q5SV17 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM240Q5SV17 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms