Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO47Q5MNV8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO47Q5MNV8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms